Le Laboratoire départemental d’analyses joue également un rôle important dans la surveillance sanitaire des troupeaux de bovins, ovins et caprins puisqu’il réalise les analyses réglementaires (sérologie et PCR) demandées par le Groupement de défense sanitaire (GDS) en lien avec les éleveurs. 

Le Département de l’Aude est le seul de France à prendre en charge l’ensemble des analyses réalisées pour les éleveurs.